民进安徽省委机关内设办公室、组织部、宣传部、社会服务部、参政议政部5个部门。各部门职能如下：
【办公室】负责处理机关内综合性日常事务，制定机关内部的有关规章制度，协调与外单位的关系，进行有关行政工作的落实与检查，负责有关文书处理、档案管理、财务管理、办公用品及办公设备的管理和配置，有关会务和后勤服务及其他具体事务工作。
【组织部】负责实施省委会的组织工作方针和计划；办理全省各级地方组织、地方干部的批准、备案事项；办  理会员的审批、备案、转移和会纪处理等事项，管理会籍档案；建立后备干部档案，负责干部的培训，推动各地后备干部队伍建设的工作；办理对先进个人、先进集体的表彰和奖励；负责人大、政协、政府实职人员和特约人员的推荐工作；负责机关的机构编制及人事管理工作。
【宣传部】负责组织学习、宣传中共中央、中共安徽省委、民进中央和民进省委有关重要会议精神，为全会思想建设服务；负责经常性、阶段性全会思想状况调研，为省委会领导指导全会思想建设提供信息；组织宣传省委会的重大政治活动及宣传民进履行参政党职能所取得的成绩；负责会内的宣传工作；了解沟通各市级组织会刊工作，承担《安徽民进》的编辑、发行工作；负责会史工作，收集整理会史资料；组织开展理论研究工作。
【社会服务部】负责组织和协调全省各级组织的助学扶贫工作；负责联系各级组织和会员个人的办学工作；负 责经济科教咨询和联系会员中的民营企业家的工作；负责组织开展海外联谊工作。
【参政议政部】负责省委会的议政调研工作，推动各级组织和会员开展调研活动；负责信息工作，反映社情民意；协调参政议政专门委员会的工作，联系参政议政骨干会员；负责参加省政协会议的提案和发言的准备工作以及提案的跟踪、办复、反馈工作。